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蛋白质原子运动轨迹生成改进算法
【出 处】：《
计算机仿真
》
CSCD
2013年第30卷第9期 398-401页,共4页
【作 者】：
张萍
;
申闫春
【摘 要】
传统实现蛋白质分子动态模拟均采用采样方式生成原子运动轨迹.较大的采样间距使原本光滑的轨迹由于时域影响变得凹凸,而小的采样间距使运动缓慢且难以辨别.为解决上述问题,提出一种基于主元分析的运动轨迹生成算法.在参考坐标系内采集所有原子位置数据,计算并构造位置差的协方差矩阵,选择主元构成新基作为投影向量,确定兴趣运动点.以PYP为例,实验验证,通过提出的算法仿真PYP运动平滑而又凸显重点.
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